Bond_Valence_OKeeffe
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**bond valenceから結合距離を見積るO'Keeffeの方法 (2013 4/...
**更新情報 [#jf43e92a]
(2022/02/21) Bond valenceパラメータはBrown先生がcifファ...
(2022/02/19) Bond valenceパラメータは元論文を見てもいい...
(2017/10/18) 解説(pdf)で使っている結晶構造の論文が出版...
(2017/5/31) 解説pdfにもBrownの方法を追加して更新
(2016/11/09) I.D. Brownの計算方法を追加した。
**O'Keeffeの計算方法 [#o5994e31]
bond valenceから結合距離を見積る必要があったので、O'Kee...
-M. O'Keeffe (1990), A method for calculating bond valenc...
I.D. Brownなどにより発展してきたbond valence法は、結晶...
逆に結合距離を推定するためにも使える。結晶構造が正確に...
bond valenceの総和が原子のvalenceに等しいので、そこから...
この計算法で各結合でbond valenceを求めることができ、そ...
計算方法の詳細(ZnSUB{SIZE(9){2}}GeOSUB{SIZE(9){4}}正方...
現在のところ、結晶構造を眺めて、connective matrixを作っ...
**注意 [#z60cfe47]
その後、他の構造を試してみたところ、この方法(Brownも同...
-適用できるケース:正方晶スピネル、変形スピネル(wadsleyit...
-適用できないケース:オリビン、ペロブスカイト構造など、ま...
**Brown(1977)の計算方法(2016/11/09追加) [#j3b704ed]
Brown(1977)の計算方法についても説明しておく。特定の結合...
-I.D. Brown(1977) Predicting bond lengths in inorganic cr...
***計算例(CaIrOSUB{SIZE(9){3}}(perovskite構造ではない)の...
まず席のつながりを考える。私は下のような表を作っている...
,,Ca,Ir,sum
,O1,2/2,2/2,4
,O2,3/6,2/4,5
,sum,8,6,
上記の説明通りに計算を行う。その時に上記の表を参照する...
各席の価数を見ると明らかに本来の価数からずれている(Caの...
後は2列目と同じ計算を、価数が本来の値に収束するまで繰...
,,1st,2nd,3rd,4th
,Ca-O1,(2/8+2/4)/2=0.375,0.375+((2.0-2.7)/8)+((2.0-1.9167...
,Ca-O2,(2/8+2/5)/2=0.325,0.325+((2.0-2.7)/8)+((2.0-2.0416...
,Ir-O1,(4/6+2/4)/2=0.58333,0.58333+((4.0-3.3)/6)+((2.0-1....
,Ir-O2,(4/6+2/5)/2=0.5333,0.5333+((4.0-3.3)/6)+((2.0-2.04...
,Ca,2*0.375+6*0.325 = 2.7,2*0.2948+6*0.2292=1.992,2.006,1...
,Ir,2*0.58333+4*0.5333=3.3,2*0.7208+4*0.6417=4.008,3.994,...
,O1,2*0.375+2*0.58333=1.9167,2*0.2948+2*0.7208=2.0583,1.9...
,O2,3*0.325+2*0.5333=2.04167,3*0.2292+2*0.6417=1.971,2.00...
***CaIrOSUB{SIZE(9){3}}結合距離予測の比較(実測の結合距離...
Brown, O'Keeffeのbond valenceは大体似た値になっている。...
,bond,構造解析結果,Brown BV,Brown距離,O'Keeffe BV, O'Keef...
,Ca-O1,2.395,0.2941,2.408,0.2747,2.435
,Ca-O2,2.476(av),0.2353,2.499,0.2418,2.488
,Ir-O1,1.939,0.7059,1.999,0.7253,1.992
,Ir-O2,2.066,0.6471,2.021,0.6374,2.025
***MgSiOSUB{SIZE(9){3}}のCaIrOSUB{SIZE(9){3}}構造への応用
ちなみにMgSiOSUB{SIZE(9){3}}は下部マントルの底でCaIrOSU...
,bond,Brown距離,O'Keeffe距離,DFT計算
,Mg-O1,2.150,2.180,2.038
,Mg-O2,2.249,2.237, 2.227+2.283
,Si-O1,1.759,1.749,1.792
,Si-O2,1.793,1.799,1.812
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**bond valenceから結合距離を見積るO'Keeffeの方法 (2013 4/...
**更新情報 [#jf43e92a]
(2022/02/21) Bond valenceパラメータはBrown先生がcifファ...
(2022/02/19) Bond valenceパラメータは元論文を見てもいい...
(2017/10/18) 解説(pdf)で使っている結晶構造の論文が出版...
(2017/5/31) 解説pdfにもBrownの方法を追加して更新
(2016/11/09) I.D. Brownの計算方法を追加した。
**O'Keeffeの計算方法 [#o5994e31]
bond valenceから結合距離を見積る必要があったので、O'Kee...
-M. O'Keeffe (1990), A method for calculating bond valenc...
I.D. Brownなどにより発展してきたbond valence法は、結晶...
逆に結合距離を推定するためにも使える。結晶構造が正確に...
bond valenceの総和が原子のvalenceに等しいので、そこから...
この計算法で各結合でbond valenceを求めることができ、そ...
計算方法の詳細(ZnSUB{SIZE(9){2}}GeOSUB{SIZE(9){4}}正方...
現在のところ、結晶構造を眺めて、connective matrixを作っ...
**注意 [#z60cfe47]
その後、他の構造を試してみたところ、この方法(Brownも同...
-適用できるケース:正方晶スピネル、変形スピネル(wadsleyit...
-適用できないケース:オリビン、ペロブスカイト構造など、ま...
**Brown(1977)の計算方法(2016/11/09追加) [#j3b704ed]
Brown(1977)の計算方法についても説明しておく。特定の結合...
-I.D. Brown(1977) Predicting bond lengths in inorganic cr...
***計算例(CaIrOSUB{SIZE(9){3}}(perovskite構造ではない)の...
まず席のつながりを考える。私は下のような表を作っている...
,,Ca,Ir,sum
,O1,2/2,2/2,4
,O2,3/6,2/4,5
,sum,8,6,
上記の説明通りに計算を行う。その時に上記の表を参照する...
各席の価数を見ると明らかに本来の価数からずれている(Caの...
後は2列目と同じ計算を、価数が本来の値に収束するまで繰...
,,1st,2nd,3rd,4th
,Ca-O1,(2/8+2/4)/2=0.375,0.375+((2.0-2.7)/8)+((2.0-1.9167...
,Ca-O2,(2/8+2/5)/2=0.325,0.325+((2.0-2.7)/8)+((2.0-2.0416...
,Ir-O1,(4/6+2/4)/2=0.58333,0.58333+((4.0-3.3)/6)+((2.0-1....
,Ir-O2,(4/6+2/5)/2=0.5333,0.5333+((4.0-3.3)/6)+((2.0-2.04...
,Ca,2*0.375+6*0.325 = 2.7,2*0.2948+6*0.2292=1.992,2.006,1...
,Ir,2*0.58333+4*0.5333=3.3,2*0.7208+4*0.6417=4.008,3.994,...
,O1,2*0.375+2*0.58333=1.9167,2*0.2948+2*0.7208=2.0583,1.9...
,O2,3*0.325+2*0.5333=2.04167,3*0.2292+2*0.6417=1.971,2.00...
***CaIrOSUB{SIZE(9){3}}結合距離予測の比較(実測の結合距離...
Brown, O'Keeffeのbond valenceは大体似た値になっている。...
,bond,構造解析結果,Brown BV,Brown距離,O'Keeffe BV, O'Keef...
,Ca-O1,2.395,0.2941,2.408,0.2747,2.435
,Ca-O2,2.476(av),0.2353,2.499,0.2418,2.488
,Ir-O1,1.939,0.7059,1.999,0.7253,1.992
,Ir-O2,2.066,0.6471,2.021,0.6374,2.025
***MgSiOSUB{SIZE(9){3}}のCaIrOSUB{SIZE(9){3}}構造への応用
ちなみにMgSiOSUB{SIZE(9){3}}は下部マントルの底でCaIrOSU...
,bond,Brown距離,O'Keeffe距離,DFT計算
,Mg-O1,2.150,2.180,2.038
,Mg-O2,2.249,2.237, 2.227+2.283
,Si-O1,1.759,1.749,1.792
,Si-O2,1.793,1.799,1.812
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